A l'université, dans les écoles supérieures, il arrive que certains cours soient en conflit avec les enseignements de la Science Chrétienne, et que les étudiants ne puissent s'en faire dispenser. La biologie par exemple traite de la vie prétendue organique chez les plantes, les animaux, les humains. Elle décrit la structure des corps matériels, la naissance, la croissance et le déclin des créatures physiques, la cause et la nature des maladies, la théorie de l'évolution et d'autres sujets analogues. Ce qu'on présente ainsi aux élèves, soit dans les cours et les laboratoires soit dans les manuels, repose sur l'hypothèse que la matière est réelle, que la vie est avant tout physique.
Cependant, le Scientiste Chrétien pour qui ce cours-là est obligatoire ne devrait pas en être inquiet; il devrait plutôt y voir une occasion de croître dans la compréhension spirituelle en opposant aux prémisses et aux conclusions erronées des sciences physiques les vérités de la Science Chrétienne. Il a pu apprendre que Dieu, l'Esprit, est Tout-en-tout, et que dès lors Sa création, renfermant la totalité des choses ayant une existence véritable, est entièrement spirituelle. Tout être reflète l'unique Vie, Dieu. Il n'y a point d'autre vie. S'attachant à ces vérités, le disciple verra que la croyance à la vie dans la matière est fausse; il pourra donc comprendre l'irréalité des théories ou des hypothèses basées sur cette fausse croyance.
Mary Baker Eddy déclare dans Science et Santé avec la Clef des Écritures (p. 282): « La Vie réelle, ou l'Entendement, et son opposé, la prétendue vie et le prétendu entendement matériels, sont figurés par deux symboles géométriques, un cercle ou une sphère, et une ligne droite. » A la même page elle ajoute: « Ces opposés ne peuvent se mêler ni s'unir. Quand même ils sembleraient se toucher, l'un est toujours une courbe et l'autre une ligne droite. »
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